Certaines œuvres sont extrêmement fragiles et doivent rester conservées en réserve à l'abri de la lumière. Il peut s'agir d'œuvres provenant des fonds suivant :
- Manuscrits : un important fonds de manuscrits comprenant des pièces de la main même de Balzac (manuscrits, correspondances, notes et épreuves corrigées) ainsi que des lettres et manuscrits signés de plumes célèbres (Colette, Bourdelle, Gautier, Dumas, etc...)
- Dessins et estampes : le fonds d’œuvres graphiques est constitué d'environ 4500 gravures et 225 dessins. Ces œuvres sont d’une part des illustrations pour La Comédie humaine, d’autre part des œuvres sur la vie et les mœurs dans la première moitié du XIXe siècle (Daumier, Gavarni, Grandville, Monnier...). S’y ajoutent des portraits de contemporains, des dessins d'artistes contemporains, des planches de bande-dessinées, ainsi que des affiches de cinéma
- Photographies : l’œuvre la plus importante est le célèbre daguerréotype de Bisson représentant Balzac en chemise. Le musée conserve également quelques négatifs sur verre et un fonds d’environ trois cents photographies anciennes, classées par thèmes ( Domiciles balzaciens, Théâtre et cinéma, Portraits de contemporains...)
- Livres et journaux : la Maison de Balzac a développé dès sa création une importante collection d'imprimés : éditions originales, éditions illustrées, livres imprimés par Balzac, exemplaires annotés, dédicacés ou enrichis de dessins. Ces collections sont conservées et consultables à la bibliothèque